巧克力是非常脆弱、嬌貴的產品， 儲存條件很講究， 除了避免陽光照射、發黴外， 儲存的地方不應有怪味， 最重要的是溫濕度的控制。
巧克力的熔點在36℃左右， 是一種熱敏性強， 不易保存的食品。 儲存溫度應該控制在12-18℃之間， 相對濕度不高於65%。 儲存不當會發生軟化變形、表面斑白、內部翻砂、串味或香氣減少等現象。
打開包裝後或沒有用完的巧克力必須再次以保鮮膜密封， 置於陰涼、乾燥及通風之處， 且溫度恒定為佳。 巧克力醬或餡料必須放入保鮮櫃中儲存。
巧克力若置於溫度過高之處， 表面會出現大片條紋或斑點。 若置於濕冷的環境下， 可能會出現灰白色的薄膜， 這些變化對巧克力的香氣和質地不會有太大影響， 仍可用於料理和烘焙。
保存得宜的話， 純巧克力及苦甜巧克力可以放上一年以上， 牛奶巧克力及白巧克力不宜存放超過六個月。 白巧克力存放過久，
總得來說隨著內容物的不同， 巧克力保質的時間會有所增減。 尤其是添加鮮奶(或牛奶成份較高)、榛果類的巧克力產品， 因為牛奶及榛果的保存期限不長， 相對縮短了巧克力的保存期間， 購買時不但要注意製造日期，
如果你有一個很涼快的房間的話， 巧克力是不需要存放在冰箱中的。 巧克力雖然不一定保存在冰箱中， 但必須保存在一種可以阻止黴菌生長的密封容器中， 在通常情況下， 應該拿到室溫環境後再打開包裝。
