用微波爐加熱冷凍食品也許非常快捷方便, 但是食品沒有充分加熱, 人食用後可能會致病。 美國12個州的32人因食用冷凍食品導致沙門氏菌中毒後, 美國政府於10月5日發佈一條新通知, 告誡消費者要徹底加熱冷凍雞肉。
堪薩斯州立大學國際食品安全網的科學主管道戈·鮑威爾說, 微波爐存在的問題是, 微波加熱並不均勻, 殘留的一些沒熱透的區域可成為大腸埃希氏菌、沙門氏菌或李氏桿菌等危險細菌的滋生地。 因此用微波加熱任何東西, 包括不管是冷凍的還是解凍的生肉, 都能引起一些不良後果。
微波產生短無線電波, 能穿透食品大約1英寸。 食品安全專家表示, 因為微波加熱不均勻, 因此它比火爐或烤箱加熱存在的安全隱患更多。 隨著時間推移, 微波會損失一些能量, 一些更短的微波也許無法產生足夠的能量, 將食品加熱到可以安全食用的程度。 專家表示, 雖然遵循說明書會有一些幫助, 但是烹飪生食時最好用火爐、烤架或烤箱加熱。